採用合理的耕作方式。在坡度較大的地區,易發生化肥徑流流失,應採取保護耕作以減少對土壤的擾動,還可利用秸稈還田減少徑流流失。在以滲漏爲化肥主要流失方式的平原地區,可採取耕作破壞土壤大孔隙,或控制排水保持土壤溼度,避免土粒乾燥產生大孔隙引起滲漏。
採用合理的灌溉方式。對旱作提倡採用滴灌、噴灌等先進灌溉方式,儘量減少大水漫灌;對水田要加強田間水管理,儘量減少農田水的排放。
採用適宜的輪作制度。適宜的輪作制度可提高化肥的利用率,減少流失。如豆科作物與其他作物輪作,可節省化肥用量;深根作物與淺根作物輪作可充分利用土壤中的養分。
有條件的地區可利用田間渠道、靠近農田的水塘和溝渠等暫時接納富營養的農田排水,灌溉時再使用,實現循環利用。
在農田和受保護的水體之間,應利用自然生態系統建立緩衝帶,或在河濱、湖濱人工設定保護帶以攔截過濾從農田流出的養分,提高營養物質的淨化能力,防止養分流入周圍河流、湖泊和水庫等水體。