①农业防治：选择无病、优质抗病种薯，整薯种植，避免缺口使病原菌侵染，在土壤湿度大，气温低时，适当延迟播种。生长期做好水肥管理，雨后及时清沟、排水，使田间湿度保持较低水平，合理增施肥料，提高抗病性，及时拔出病株，避免病原菌大面积侵染。适时乘晴天收获，在搬运贮藏过程中，尽量避免相互踫撞、挤压造成伤口。储藏时要清除病、虫、伤薯，并在通风干燥的地方。②化学防治：用有机汞化物来防治干腐病。播种时采用58%甲霜灵锰锌可湿性粉剂，25%多菌灵、甲霜灵锰锌等药剂浸泡，喷雾或熏蒸处理种薯。还可用硫磺粉、高猛酸钾与甲醛的混合剂或百菌清进行熏蒸。
重要防治时期：开花期和果实膨大期。（1）生长后期注意排水，收获时避免伤口，收获后充分晾干再入窖，严防碰伤。（2）窖内保持通风干燥，窖温控制在1～4℃，发现病烂薯及时汰除。
1.生长后期注意排水，收获时避免伤口，收获后充分晾干再入窖，严防碰伤。2.窖内保持通风干燥，窖温控制在1～4℃，发现病烂薯及时汰除。
（1）收获运贮期间尽量避免薯块受伤，减少侵染。收获后适当干燥待愈伤后入窖贮存。（2）贮藏入窖前清除病、伤薯；也可用杀菌剂（如多菌灵等）喷洒消毒种薯。（3）贮藏早期适当提高温度，搞好通风，促进伤口愈合；以后控制温度在1～4℃间，减少发病。（4）种薯切块后尽快播种；适当晚播，地温升高利于伤口愈合；用杀菌剂处理芽块，减少侵染源；用未污染的器具运送、播种种薯。
马铃薯生产中，常采用有机汞化合物（2-甲基氧乙基氯化汞）来防治干腐病。播种时，采用58%甲霜灵？锰锌可湿性粉剂、2.5%咯菌腈悬浮种衣剂和链霉素混合液拌种，可有效防止干腐病的发生。贮藏时，可用苯来特、多菌灵、甲霜灵锰锌等药剂浸泡；喷雾、喷粉或熏烟处理种薯也可减轻干腐病，但成本相对较高。用硫磺粉、高锰酸钾与甲醛的混合剂或百菌清等熏蒸方法对储窖进行全面消毒也可达到同样的效果。
运用农业防治，绿色环保生物防治相结合的方法。
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